Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Syne2Q6ZWQ0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Syne2Q6ZWQ0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms