Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
NinlQ6ZQ12 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NinlQ6ZQ12 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NinlQ6ZQ12 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NinlQ6ZQ12 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NinlQ6ZQ12 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NinlQ6ZQ12 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NinlQ6ZQ12 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
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