Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms