Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp8b3Q6UQ17 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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