Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scgb2b2Q6UGQ3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scgb2b2Q6UGQ3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scgb2b2Q6UGQ3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scgb2b2Q6UGQ3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scgb2b2Q6UGQ3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scgb2b2Q6UGQ3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scgb2b2Q6UGQ3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scgb2b2Q6UGQ3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms