Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc1Q6TDU8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms