Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gja6Q6S5G4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gja6Q6S5G4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms