Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt9Q6RHW0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt9Q6RHW0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms