Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rrm2bQ6PEE3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrm2bQ6PEE3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms