Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarcc2Q6PDG5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcc2Q6PDG5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms