Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SvoplQ6PDF3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SvoplQ6PDF3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms