Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc3bQ6PDC0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc3bQ6PDC0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms