Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ttbk1Q6PCN3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ttbk1Q6PCN3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ttbk1Q6PCN3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms