Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Papd7Q6PB75 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Papd7Q6PB75 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Papd7Q6PB75 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Papd7Q6PB75 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Papd7Q6PB75 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Papd7Q6PB75 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Papd7Q6PB75 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Papd7Q6PB75 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Papd7Q6PB75 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Papd7Q6PB75 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Papd7Q6PB75 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Papd7Q6PB75 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Papd7Q6PB75 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
Papd7Q6PB75 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Papd7Q6PB75 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms