Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B2

Ubald1, UBA-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubald1Q6P3B2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubald1Q6P3B2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubald1Q6P3B2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms