Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E8

Efcab6, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab6Q6P1E8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efcab6Q6P1E8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efcab6Q6P1E8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efcab6Q6P1E8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efcab6Q6P1E8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efcab6Q6P1E8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efcab6Q6P1E8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Efcab6Q6P1E8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Efcab6Q6P1E8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Efcab6Q6P1E8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Efcab6Q6P1E8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Efcab6Q6P1E8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Efcab6Q6P1E8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Efcab6Q6P1E8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Efcab6Q6P1E8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Efcab6Q6P1E8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Efcab6Q6P1E8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Efcab6Q6P1E8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Efcab6Q6P1E8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Efcab6Q6P1E8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms