Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Frem2Q6NVD0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frem2Q6NVD0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms