Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
Smarca2Q6DIC0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Smarca2Q6DIC0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Smarca2Q6DIC0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms