Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Thsd7aQ69ZU6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Thsd7aQ69ZU6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Thsd7aQ69ZU6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms