Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114 ms