Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgefl1Q68EF8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rapgefl1Q68EF8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgefl1Q68EF8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms