Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3ipQ68EF0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms