Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gja3Q64448 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja3Q64448 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms