Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp248Q640N4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms