Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PatjQ63ZW7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms