Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lcn4Q62472 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lcn4Q62472 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms