Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp1Q62442 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp1Q62442 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms