Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl12Q62401 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms