Protein–RNA interactions for Protein: Q62398

Cnga2, Cyclic nucleotide-gated olfactory channel, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga2Q62398 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga2Q62398 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga2Q62398 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga2Q62398 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga2Q62398 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga2Q62398 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga2Q62398 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga2Q62398 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga2Q62398 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga2Q62398 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga2Q62398 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga2Q62398 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga2Q62398 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga2Q62398 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga2Q62398 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga2Q62398 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnga2Q62398 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnga2Q62398 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnga2Q62398 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnga2Q62398 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnga2Q62398 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnga2Q62398 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnga2Q62398 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga2Q62398 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga2Q62398 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga2Q62398 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga2Q62398 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga2Q62398 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga2Q62398 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga2Q62398 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnga2Q62398 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnga2Q62398 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms