Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52Q62393 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms