Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sycp1Q62209 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sycp1Q62209 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms