Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctr9Q62018 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctr9Q62018 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms