Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itga6Q61739 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga6Q61739 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms