Protein–RNA interactions for Protein: Q61292

Lamb2, Laminin subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb2Q61292 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamb2Q61292 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamb2Q61292 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb2Q61292 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb2Q61292 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb2Q61292 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb2Q61292 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamb2Q61292 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamb2Q61292 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamb2Q61292 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lamb2Q61292 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lamb2Q61292 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamb2Q61292 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lamb2Q61292 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lamb2Q61292 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lamb2Q61292 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamb2Q61292 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamb2Q61292 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamb2Q61292 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms