Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Trpc6Q61143 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Trpc6Q61143 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Trpc6Q61143 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc6Q61143 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Trpc6Q61143 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Trpc6Q61143 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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Trpc6Q61143 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
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Trpc6Q61143 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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