Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rbbp7Q60973 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp7Q60973 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms