Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp4Q60972 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 349.1 ms