Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot7Q60809 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms