Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Atf3Q60765 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atf3Q60765 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms