Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Foxd4Q60688 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Foxd4Q60688 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Foxd4Q60688 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Foxd4Q60688 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Foxd4Q60688 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Foxd4Q60688 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Foxd4Q60688 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Foxd4Q60688 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Foxd4Q60688 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Foxd4Q60688 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Foxd4Q60688 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Foxd4Q60688 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Foxd4Q60688 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Foxd4Q60688 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Foxd4Q60688 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxd4Q60688 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxd4Q60688 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms