Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgaeQ60677 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgaeQ60677 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms