Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thoc6Q5U4D9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Thoc6Q5U4D9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms