Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdcp1Q5U462 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdcp1Q5U462 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdcp1Q5U462 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms