Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms