Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brip1Q5SXJ3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms