Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsr1Q5SWD9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms