Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r196Q5SVD5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms