Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sft2d1Q5SSN7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms