Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d4Q5RJF7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms