Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarf1Q5ND28 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarf1Q5ND28 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Scarf1Q5ND28 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Scarf1Q5ND28 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scarf1Q5ND28 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scarf1Q5ND28 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scarf1Q5ND28 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms